从蛋白质结合到药代动力学:一种预测活性药物吸收的新方法
定量方法
2008-10-16 v1 生物大分子
摘要
由于固有的复杂性,主动转运是口服吸收性质预测的一个标志性障碍。我们提出了一种基于与 QSPR 完全不同的范式来计算载体介导的药物吸收参数的新方法。我们利用了最近出现的观点,即分子对大量蛋白质集合的活性可用于预测生物效应,并对药物样化合物与大量多样化蛋白质集合进行了大规模数值对接。结果,我们首次识别出一种蛋白质,其结合与许多主动吸收化合物的肠道通透性良好相关。尽管该蛋白质不是转运蛋白,但我们推测其结合位点力场与某种重要的肠道转运蛋白相似。这一观察帮助我们改进了被动吸收模型,通过添加与转运蛋白相关的非线性通量,获得了主动转运的定量模型。这项研究表明,对足够代表性蛋白质集合的结合数据可以作为预测给定化合物主动吸收的基础。
引用
@article{arxiv.0810.2617,
title = {From protein binding to pharmacokinetics: a novel approach to active drug absorption prediction},
author = {P. O. Fedichev and T. V. Kolesnikova and A. A. Vinnik},
journal= {arXiv preprint arXiv:0810.2617},
year = {2008}
}
备注
9 pages, 5 eps figures