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多组分蛋白质混合物中的特异性蛋白质-蛋白质结合

生物大分子 2007-05-23 v2 分子网络

摘要

蛋白质在体内必须结合到特异的其他蛋白质才能发挥功能。这些蛋白质必须仅结合到体内通常存在的约一千个蛋白质中的一个或少数几个。利用一个简单的蛋白质模型,研究了多组分混合物中的特异性结合。发现这是一个苛刻的功能,在于它要求蛋白质的绑定位点由长的比特序列编码,而特异性结合的要求则强烈约束这些序列。这由给定大小(序列长度)蛋白质的容量量化,即混合物中可能的特异性结合相互作用的最大数目。此最大可能性的计算精神与 Shannon 等人关于噪声信道最大通信速率的工作一致。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0312033,
  title  = {Specific protein-protein binding in many-component mixtures of proteins},
  author = {Richard P. Sear},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0312033},
  year   = {2007}
}

备注

13 pages, 3 figures (changes for v2 mainly notational - to be more in line with notation in information theory literature)