RecA介导的同源识别的物理学
生物大分子
2009-11-10 v1 统计力学
基因组学
摘要
大多数参与DNA加工的蛋白质以单体或包含相对少量其他元件的多聚体组分的形式发挥其活性。它们通常局部作用,结合DNA底物的一个或几个小区域。显著的例外是\textit{E. coli}蛋白RecA及其在其他物种中的同源物,其活性与同源DNA重组相关。RecA在DNA重组中的活性形式是由RecA和DNA形成的刚性核蛋白丝,其中DNA被拉伸了50%。利用物理和几何概念,我们表明这种丝状组织极大地提高了同源识别的速率,同时防止了由多位点识别产生的拓扑陷阱的形成。
引用
@article{arxiv.q-bio/0402008,
title = {Physics of RecA-mediated homologous recognition},
author = {Kevin Klapstein and Tom Chou and Robijn Bruinsma},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0402008},
year = {2009}
}
备注
12pp, 10 figures