自指涉的 DNA 与蛋白质:关于物理与几何方面的评述
其他定量生物学
2018-04-13 v2 生物物理
摘要
所有已知生命形式都基于一套交织的反馈回路层级,运作于空间、时间与能量尺度的级联之上。其中最基础的回路包括连接 DNA 与蛋白质的那些。例如,在基因网络中,DNA 基因被表达为蛋白质,这些蛋白质可能结合于相同基因附近从而控制自身的表达。在这种分子类型的自指涉中,信息从 DNA 序列映射到蛋白质再回到 DNA。存在多种动态的 DNA-蛋白质自指涉回路,本评述旨在讨论与 DNA 和蛋白质之间来回映射相关的某些几何与物理方面。该讨论提出了关于 DNA 与蛋白质作为自指涉物质的本质的基本问题,这些在一个简单玩具模型中得以考察。
引用
@article{arxiv.1804.03430,
title = {The self-referring DNA and protein: a remark on physical and geometrical aspects},
author = {Tsvi Tlusty},
journal= {arXiv preprint arXiv:1804.03430},
year = {2018}
}
备注
17 pages, 9 figures; title updated and typos corrected