最小矛盾方法在连续性状上的系统发育应用
定量方法
2009-06-11 v1 天体物理仪器与方法
摘要
我们描述了连续变量或性状集合可以被描述为X树或分裂网络的条件。如果在对分类群排序后，变量值可以嵌入到一个最多有一个局部最大值和一个局部最小值、且与任何水平线最多相交两次的函数中，那么距离矩阵恰好对应一个分裂网络或带权X树。在实际应用中，可以使用最小矛盾方法获得最佳满足上述条件的分类群顺序。该方法应用于两组连续性状。第一组对应人科动物的颅面标志点。矛盾矩阵用于识别可能的树状结构及其存在的替代方案。我们解释了如何发现树中的主要结构化性状。第二组由100个星系的样本组成。在第二个例子中，我们展示了如何在不破坏底层树状结构的情况下离散化描述星系物理性质的连续变量。
引用
@article{arxiv.0905.2481,
title = {Phylogenetic Applications of the Minimum Contradiction Approach on Continuous Characters},
author = {Marc Thuillard and Didier Fraix-Burnet},
journal= {arXiv preprint arXiv:0905.2481},
year = {2009}
}
备注
To appear in Evolutionary Bioinformatics