优化氦气与氮气环境下的原生离子淌度 Q-TOF 以分析极脆弱非共价相互作用
定量方法
2018-09-07 v3 生物大分子
摘要
在不同平台上对离子淌度(IM)结果和碰撞截面(CCS)值进行有意义的比较，是将 CCS 用于鉴定或结构归属的先决条件。在离子进入离子淌度池之前赋予离子的内能是实验变异的一个来源。本文中，我们研究了 Agilent 6560 IM-Q-TOF 几乎所有调谐参数对 Ubiquitin7+ 到达时间分布的影响，并找到了原生态占主导的条件。我们将讨论源中溶剂蒸发条件、整个预 IM 直流电压梯度以及漏斗 RF 幅度的影响，并报道在不同溶剂（包括原生超电荷条件）中 ubiquitin7+ 的构象。碰撞诱导展开(CIU)可方便地在两个不同区域触发：源毛细管之后（通过改变 fragmentor 电压）和捕获漏斗中（通过改变 trap entrance grid delta 电压）。随后以基准 DNA G-四链体 [(dG4T4G4)2.(NH4+)3-8H]5- 优化了仪器的柔和条件，其离子活化会导致氨损失。为降低离子内能并获得完整的 3-NH4+ 复合物，我们减小了 IM 后电压梯度，但由于漂移管后扩散增加，这导致 IM 分辨力降低。因此，本文描述了针对极脆弱结构的原生 MS 中离子活化、离子传输与离子淌度性能之间的各种权衡。
引用
@article{arxiv.1805.01735,
title = {Optimizing Native Ion Mobility Q-TOF in Helium and Nitrogen for Very Fragile Noncovalent Interactions},
author = {Valérie Gabelica and Sandrine Livet and Frédéric Rosu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.01735},
year = {2018}
}
备注
25 pages including 12 figures