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nlive:一个便于应用 S 形与随机变点混合模型的 R 包

统计方法学 2024-01-26 v2

摘要

背景:使用具有特定函数形式的混合效应模型,如 S 形混合模型以及具有突变或平滑随机变化的分段混合模型(或变点混合模型),可通过对所定义参数的解释来理解纵向轨迹。目前,尚无接口 R 包能够轻松拟合 S 形混合模型并允许纳入协变量,或结合近期进展来拟合具有随机变化的分段混合模型。结果:为便于建模 S 形混合模型以及具有突变或平滑随机变化的分段混合模型,我们创建了一个名为 nlive 的 R 包。所有需要的组件,如函数、协方差矩阵和初值生成,均已编程实现。该包结合了近期进展,例如分段混合模型的多项式平滑转移(相较 Bacon-Watts 具有改进性质),以及用于高效估计的随机近似期望最大化(SAEM)。其设计旨在通过提供带注释的输出、警告和图形等特性来帮助解释输出结果。包括时间与收敛性在内的功能性已通过模拟进行测试。我们提供了一个数据示例以说明该包的使用、输出特性及解释。该在 R 软件中实现的包可从 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 获取,地址为 https://CRAN.R-project.org/package=nlive。结论:用于 R 的 nlive 包可拟合 S 形混合模型以及分段混合模型:突变与平滑。nlive 仅需五个直观的必填参数即可拟合这些模型,对不太专业的用户也足够友好。

关键词

引用

@article{arxiv.2302.10836,
  title  = {nlive: an R Package to facilitate the application of the sigmoidal and random changepoint mixed models},
  author = {Ana W Capuano and Maude Wagner},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2302.10836},
  year   = {2024}
}