piecewiseSEM：面向生态学、进化论与系统学的 R 语言分段结构方程建模
定量方法
2015-09-08 v1 种群与进化
摘要
生态学家和进化生物学家正依赖一套日益复杂的统计工具来描述复杂的自然系统。其中一种在生命科学中日益受到青睐的工具是结构方程建模（SEM），它是路径分析的一种变体，用于解析一组相互关联变量间的复杂多元关系。SEM 历来依赖变量间的协方差，而非数据点本身的值。虽然这种方法允许广泛的模型形式，但它限制了对详细规格的纳入。在此，我呈现一个完整文档化的开源 R 包 piecewiseSEM，它基于基础 R 语法构建，适用于当前所有广义线性模型、最小二乘模型和混合效应模型。我还提供了两个工作示例：一个涉及具有非正态分布变量的分层数据集，另一个涉及系统发育独立对比。我的目标是提供一个用户友好且易于操作的 SEM 实现，同时反映生成数据的生态学和方法学过程。
引用
@article{arxiv.1509.01845,
title = {piecewiseSEM: Piecewise structural equation modeling in R for ecology, evolution, and systematics},
author = {Jonathan S. Lefcheck},
journal= {arXiv preprint arXiv:1509.01845},
year = {2015}
}
备注
20 pages, 2 figures