MAPK 网络及其因环面稳态而具备的多稳态能力
分子网络
2014-03-27 v1
摘要
丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 信号通路在将环境刺激转导至细胞核从而调节细胞增殖、分化和程序性细胞死亡等多种细胞过程中发挥着至关重要的作用。MAPK 细胞外信号调节激酶 (ERK) 级联反应的组分是癌症治疗的诱人靶点，因为其异常激活在常见的人类癌症中频繁发生。MAPK 网络是计算模拟的模型，主要使用常微分方程和偏微分方程。关键结果表明，这些网络可表现出开关行为、双稳态和振荡。在本工作中，我们考虑了三个具有代表性的 ERK 网络，其中一个具有负反馈回路，它们在质量作用动力学下呈现二项式稳态理想。因此，我们应用 P\'erez Mill\'an 等人 (2012) 提出的理论结果，为每个网络找到一组速率常数，使得在同一化学计量相容类中存在两个显著不同的稳定稳态。我们的方法使得无需依赖模拟即可研究系统的某些方面（如多稳态），因为我们除了网络拓扑外不先验假设任何常数。由于所进行的分析具有通用性，它可应用于许多其他重要的生化网络。
引用
@article{arxiv.1403.6702,
title = {MAPK's networks and their capacity for multistationarity due to toric steady states},
author = {Mercedes Pérez Millán and Adrián G. Turjanski},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.6702},
year = {2014}
}