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非对称稳定 Lévy 噪声下基因调控系统转录的似然性

生物物理 2018-03-02 v5 动力系统 分子网络

摘要

本工作致力于研究当合成反应速率受加性和乘性非对称稳定 Lévy 波动影响时,基因调控系统中浓度的演化。通过关注噪声概率分布中偏度(即非对称性)的影响,我们发现,通过考察平均首次逃出时间(MFET)和首次逃逸概率(FEP),非对称波动与系统中的非线性相互作用,导致了转录似然性的奇特现象。这包括:在加性噪声情况下,较大的正偏度(即非对称性)指数 β\beta 实现了更高的转录似然性,在非高斯性指数值 α=1\alpha=1 处引起随机分岔(即它是转录似然性的分界点或分界线),并在阈值 β0.5\beta \approx -0.5 处达到转折点(即超过此点后,转录似然性在 α\alpha 值上突然反转)。随机分岔和转折点现象在对称噪声情况(β=0\beta =0)下不会发生。而在乘性噪声情况下,非高斯性指数值 α=1\alpha=1 是平均首次逃出时间(MFET)和首次逃逸概率(FEP)的分界点或分界线。我们还研究了噪声增强稳定性现象。此外,我们能够为非对称噪声指定整个参数空间中的区域,在这些区域中我们获得了期望的转录似然性。我们进行了一系列通过调节非对称稳定 Lévy 噪声指数来“调控”基因转录似然性的数值实验。本工作为在实验研究中实现基因调控的可能途径提供了见解。

关键词

引用

@article{arxiv.1705.06479,
  title  = {Likelihood for transcriptions in a genetic regulatory system under asymmetric stable L\'evy noise},
  author = {Hui Wang and Xiujun Cheng and Jinqiao Duan and Jürgen Kurths and Xiaofan Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1705.06479},
  year   = {2018}
}

备注

27 pages, 19 figures