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无领袖确定性化学反应网络

计算复杂性 2013-04-17 v1 分布式、并行与集群计算 数据结构与算法 分子网络

摘要

本文回答了 Chen、Doty 和 Soloveichik [1] 提出的一个开放性问题,他们证明了函数 f:N^k --> N^l 可由随机化学反应网络 (CRN) 确定性计算,当且仅当 f 的图像是 N^{k+l} 的半线性子集。该构造关键性地使用了“领袖”:即能够以常数但非零计数的物种(除代表函数 f 输入的 k 个物种 X_1,...,X_k 外)作为初始配置启动。作者询问不含领袖的确定性 CRN 是否保留相同的能力。我们对此给出了肯定的回答,证明了每个半线性函数都可由一个初始配置仅包含输入物种 X_1,...,X_k 且其他所有物种计数为零的 CRN 进行确定性计算。我们表明,该 CRN 在期望时间 O(n) 内完成,其中 n 是输入分子的总数。这一时间界限慢于 [1] 中实现的 O(log^5 n),但快于 [1] 直接构造所实现的 O(n log n)([1] 最新在线版本中的定理 4.1),因为该论文的快速构造(定理 4.4)严重依赖于使用一种快速但有误差的 CRN 来计算任意可计算函数,而该构造关键性地使用了领袖。

关键词

引用

@article{arxiv.1304.4519,
  title  = {Leaderless deterministic chemical reaction networks},
  author = {David Doty and Monir Hajiaghayi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1304.4519},
  year   = {2013}
}

备注

arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1204.4176