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利用原子力显微镜研究HIV-1 Gag与RNA及脂质的结合

生物大分子 2020-07-01 v1

摘要

利用原子力显微镜在0.1{\AA}垂直分辨率和1nm横向分辨率的溶液环境中研究Gag、{\Psi}RNA及其与脂质的结合复合物的形态。使用TARpolyA RNA作为RNA对照。所用脂质为磷脂酰肌醇-(4,5)-二磷酸(PI(4,5)P2)。研究了Gag-{\Psi}RNA、Gag-TARpolyA RNA、Gag-PI(4,5)P2以及PI(4,5)P2-{\Psi}RNA-Gag特定复合物的形态。根据所带净电荷,它们在带正电或负电的云母基底上成像。Gag及其复合物由单体、二聚体和四聚体组成,经凝胶电泳确认。发现向Gag中加入特异性{\Psi}RNA会增加Gag多聚化。发现非特异性TARpolyA RNA不会导致Gag多聚化增加。向Gag中加入PI(4,5)P2会增加Gag多聚化,但程度小于{\Psi}RNA。当{\Psi}RNA和PI(4,5)P2同时存在时,Gag发生构象变化并实现更高程度的多聚化。

关键词

引用

@article{arxiv.1905.10923,
  title  = {Investigation of HIV-1 Gag binding with RNAs and Lipids using Atomic Force Microscopy},
  author = {Shaolong Chen and Jun Xu and Mingyue Liu and A. L. N. Rao and Roya Zandi and Sarjeet S. Gill and Umar Mohideen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1905.10923},
  year   = {2020}
}