蛋白质中的本征均方位移
生物物理
2015-06-04 v2 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
蛋白质中氢及其相关水合水的热均方位移（MSD）通过中子散射实验测量，并用作蛋白质功能的指标。目前测得的观测 MSD 取决于所用中子散射仪器的能量分辨率宽度。我们提出了一种获取蛋白质中 H 的本征 MSD 的方法，该方法与仪器分辨率宽度无关。本征 MSD 定义为德拜-沃勒因子中出现的 <r^2> 的无限时间值。该方法包括将一个模型拟合到经分辨率展宽的弹性非相干结构因子或依赖于分辨率的 MSD。该模型包含本征 MSD、仪器分辨率宽度以及表征蛋白质中 H 运动的速率常数。通过从文献数据中获取硫酸乙酰肝素（HS-0.4）、核糖核酸酶 A 和葡萄球菌核酸酶（SNase）的本征 MSD <r^2>，对该方法进行了说明。
引用
@article{arxiv.1202.5591,
title = {Intrinsic Mean Square Displacements in Proteins},
author = {Derya Vural and Henry R. Glyde},
journal= {arXiv preprint arXiv:1202.5591},
year = {2015}
}