对SARS-CoV-2奥密克戎变异株的计算分析见解：宿主-病原体相互作用、致病性与可能疗法

奥密克戎（Omicron）在世界试图从先前两波疫情中恢复之际显著导致了COVID-19病例的激增，并进一步威胁了常规治疗方法。奥密克戎是第五种关切变异株（VOC），其刺突蛋白受体结合域（RBD）包含超过10个突变。然而，关于奥密克戎广泛研究的缺乏引发了通过结构比较建立关联以理解该变异株的需求。在此，我们通过免疫信息学方法评估、关联并比较其基因组序列与野生及突变型刺突蛋白RBD，以理解其流行病学特征及对现有药物的响应，从而优化患者管理。我们的计算分析提供了对奥密克戎变异株传染与致病轨迹的见解。此外，分析显示南非的奥密克戎变异株与高传染性的B.1.620变异株相似，而显著蛋白质内的突变被假设会改变其致病性。 moreover，对接评估揭示了与人受体ACE2和NRP1结合亲和力的显著差异。由于其使现有治疗失效的特性，我们通过分子对接方法评估了药物对奥密克戎编码靶蛋白的疗效。大多数受试药物被证明有效。奈玛特韦（Paxlovid）、MPro 13b和洛匹那韦显示出增强的有效性与疗效，而伊维菌素对奥密克戎显示出最佳结果。