基于早期监测对 Omicron SARS-CoV-2 变异株的合理情景建模
种群与进化
2024-12-02 v2 物理与社会
摘要
我们采用空间显式基于个体的 SARS-CoV-2 传播模型，结合来自 Public Health Scotland 的空间精细 COVID-19 观测数据，研究关切变异株 Omicron（BA.1）的初始增长。我们基于当时可得的数据，评估了相对于 Delta 变异株在传播率优势与疫苗免疫逃逸方面的合理情景。我们还探讨了不同级别非药物干预措施的可能结果。这些情景的初步结果用于在 Omicron 变异株早期暴发阶段为苏格兰政府提供信息。利用在 Delta 变异株流行期拟合参数的模型、关于 Omicron 传播率优势与疫苗逃逸的一些初始假设，以及简单的增长率拟合流程，我们得以捕捉 Omicron 的初始暴发动态。我们发现建模动态经得起回顾性审视。考虑到 Omicron 变异株具有的传播率优势以及计划干预在暴发轨迹中实施过晚的事实，当时苏格兰政府计划的额外非药物干预建模结果显示可能效果甚微。最后，我们发现模型人群中对疫苗预期分布的任何假设对结果（就暴发规模与时机而言）影响很小。相反，既往免疫的格局最为重要。
引用
@article{arxiv.2211.13704,
title = {Modelling plausible scenarios for the Omicron SARS-CoV-2 variant from early-stage surveillance},
author = {Christopher J. Banks and Ewan Colman and Anthony Wood and Thomas Doherty and Rowland R. Kao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.13704},
year = {2024}
}