Omicron BA.2 (B.1.1.529.2)：成为下一个主导变异株的高潜力
种群与进化
2022-02-11 v1 生物大分子
摘要
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的 Omicron 变异株由于自然选择，已迅速取代 Delta 变异株成为主导的 SARS-CoV-2 变异株，自然选择青睐具有更高传染性和更强疫苗突破能力的变异株。Omicron 有三个谱系或亚变异株，即 BA.1 (B.1.1.529.1)、BA.2 (B.1.1.529.2) 和 BA.3 (B.1.1.529.3)。其中，BA.1 是目前流行的亚变异株。BA.2 与 BA.1 共享 32 个突变，但有 28 个不同的突变。BA.3 与 BA.1 和 BA.2 共享其大部分突变，仅有一个例外。研究发现 BA.2 能够惊人地再次感染最初感染过 Omicron BA.1 的患者。一个重要的问题是 BA.2 或 BA.3 是否会成为新的流行“关切变异株”。目前，尚无关于 BA.2 和 BA.3 的实验数据报道。我们构建了一个基于新型代数拓扑的深度学习模型，该模型使用数万个突变和深度突变数据进行训练，以系统评估 BA.2 和 BA.3 的传染性、疫苗突破能力和抗体抗性。我们对所有主要变异株，即 Alpha、Beta、Gamma、Delta、Lambda、Mu、BA.1、BA.2 和 BA.3 的比较分析揭示，BA.2 的传染性分别是 BA.1 和 Delta 的约 1.5 倍和 4.2 倍。它逃避当前疫苗的能力也分别是 BA.1 和 Delta 的 30% 和 17 倍。因此，我们预测 Omicron BA.2 正在成为下一个流行变异株。我们预测，与 Omicron BA.1 一样，BA.2 也将严重损害大多数现有单克隆抗体 (mAbs) 的有效性，但由葛兰素史克开发的 sotrovimab 除外。
引用
@article{arxiv.2202.05031,
title = {Omicron BA.2 (B.1.1.529.2): high potential to becoming the next dominating variant},
author = {Jiahui Chen and Guo-Wei Wei},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.05031},
year = {2022}
}