基于溯祖隐马尔可夫模型的人口历史推断:综述与展望
种群与进化
2018-07-10 v1
摘要
研究多样人类群体的亲缘关系具有历史与人类学意义,也为检测自然选择或疾病关联信号提供现实的零模型。此外,理解其他物种的人口统计历史在保护遗传学中正扮演日益重要的角色。已开发若干统计方法利用全基因组测序数据推断群体人口历史,近期进展聚焦于允许更灵活的建模选择、扩展到更大数据集以及提高统计功效。在此我们综述溯祖隐马尔可夫模型——一类可有效利用连锁不平衡信息的群体遗传推断方法。我们强调近期进展,为实践者提供建议,指出潜在陷阱,并给出可能的未来研究方向。
引用
@article{arxiv.1807.02763,
title = {Inference of Population History using Coalescent HMMs: Review and Outlook},
author = {Jeffrey P. Spence and Matthias Steinrücken and Jonathan Terhorst and Yun S. Song},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.02763},
year = {2018}
}
备注
12 pages, 2 figures