基于巴西医院数据推断 COVID-19 流行病学分布
种群与进化
2020-08-25 v2
摘要
了解 COVID-19 流行病学分布（如患者入院至死亡的时间）直接关系到有效的初级与次级医疗规划，且对疫情的一般数学建模至关重要。我们利用来自巴西 Sistema de Informação de Vigilância Epidemiológica da Gripe 数据库的大型数据集（），确定了 COVID-19 住院患者的流行病学分布。采用具有部分池化的联合贝叶斯次国家模型同时描述巴西的 26 个州与一个联邦区，结果显示症状发作至死亡时间的均值存在显著变异，各州范围介于 11.2–17.8 天，巴西整体均值为 15.2 天。我们发现支持特定概率密度函数选择的强证据：例如，gamma 分布对发作至死亡拟合最佳，广义对数正态对发作至入院拟合最佳。我们的结果表明流行病学分布具有相当大的地理差异，并提供了中低收入环境下这些分布的首次估计。在次国家层面，COVID-19 结局时间的变异被发现与贫困、剥夺及隔离水平相关，与平均年龄、财富及城市化程度的关联较弱。
引用
@article{arxiv.2007.10317,
title = {Inference of COVID-19 epidemiological distributions from Brazilian hospital data},
author = {Iwona Hawryluk and Thomas A. Mellan and Henrique H. Hoeltgebaum and Swapnil Mishra and Ricardo P. Schnekenberg and Charles Whittaker and Harrison Zhu and Axel Gandy and Christl A. Donnelly and Seth Flaxman and Samir Bhatt},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.10317},
year = {2020}
}