诱导契合、构象选择与独立动态片段:结合事件的扩展视角
生物大分子
2010-10-05 v2 适应与自组织系统
摘要
单分子和核磁共振测量对蛋白质动力学的测量日益揭示出结合场景的复杂性。本文描述了一个扩展的构象选择模型,该模型涵盖了一系列选择和调整过程。诱导契合可被视为该系列的一个子集,其贡献受稳定相互作用的键类型以及相互作用伙伴之间差异的影响。我们认为,其动力学与蛋白质其余部分不同的蛋白质片段(“离散呼吸子”)可以控制伴随结合过程的构象转变和别构传播,因此可能对突变事件更敏感。此外,我们强调了结合场景的动态复杂性,因为它们与聚集和信号传导等事件以及拥挤的细胞环境相关。
引用
@article{arxiv.1005.0348,
title = {Induced fit, conformational selection and independent dynamic segments: an extended view of binding events},
author = {Peter Csermely and Robin Palotai and Ruth Nussinov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1005.0348},
year = {2010}
}
备注
9 pages, 2 Figures, 1 Table, 2 boxes, Trends in Biochemical Sciences 2010 October issue cover story