如何基于化学弛豫速率区分构象选择与诱导契合
生物大分子
2016-09-22 v1 生物物理
摘要
蛋白质结合通常涉及构象变化。重要的问题在于构象变化是发生在结合事件之前(“构象选择”)还是结合事件之后(“诱导契合”),以及如何从实验中获取构象转变速率。在本文中,我们给出了构象选择与诱导契合结合过程的化学弛豫速率的一般结果,这些结果适用于所有浓度的蛋白质和配体,从而超越了配体浓度较大的标准准一阶近似。这些结果允许区分构象选择与诱导契合过程——即使在准一阶条件下无法进行这种区分的情况下——并从化学弛豫数据中提取蛋白质的构象转变速率。
引用
@article{arxiv.1609.06021,
title = {How to distinguish conformational selection and induced fit based on chemical relaxation rates},
author = {Fabian Paul and Thomas R. Weikl},
journal= {arXiv preprint arXiv:1609.06021},
year = {2016}
}
备注
20 pages, 4 figures