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假设:逾渗聚集是蛋白质-蛋白质相互作用中的新兴范式吗?

组织与器官 2007-05-23 v1 分子网络

摘要

生物复杂性的进化、调控和维持由充满动态事件的蛋白质-蛋白质相互作用网络决定。最近的实验证据指出,蛋白质聚集在许多细胞过程中起着至关重要的作用。荧光成像方法的兴起为我们探测细胞和亚细胞区室中蛋白质相互作用的能力注入了新的活力。尽管检测灵敏度不断提高,但从这些成像方法中能获得的定量信息仍然有限。这主要是由于(i)难以对问题进行解析追踪,以及(ii)实时 interrogating 活细胞所能达到的时空分辨率存在局限性。本文提出了一种基于扩散驱动的逾渗聚集的新观点,它可能为蛋白质-蛋白质相互作用的复杂问题提供更多启示。由于该模型可进行计算分析,其前提是定量的。除了能够分析现象外,任何模型的力量还在于其预测现象本身有趣和新颖特征的能力,这些特征随后可通过额外实验进行检验。为此,提出了一种基于荧光寿命成像的实验测定方法来验证逾渗模型的有效性。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0404003,
  title  = {Hypothesis: Is percolative clustering an emerging paradigm in protein-protein interactions ?},
  author = {RV Krishnan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0404003},
  year   = {2007}
}

备注

15 pages, 2 figures, Submitted to BMC Cell biology