整合异构知识以理解生物行为:一种概率方法
定量方法
2009-09-29 v1
摘要
尽管分子技术近期有所改进,生物学知识仍然不完整。对生命系统的推理因此意味着要整合异构且部分的信息。虽然当前研究成功地关注大分子网络的定性行为,但其他方法展示了部分定量信息,如蛋白质浓度随时间的变化。我们认为,定性和定量信息都必须结合到一种建模方法中,以更好地理解生物系统。我们在此提出了一种使用类概率方法的建模方法。在详尽描述该方法后,我们通过模拟大肠杆菌的碳饥饿响应来说明其优势。为此,我们基于可用观察构建了一个原创的定性模型。在正式验证其定性性质后,概率模型显示出符合生物学预期的定量结果,这证实了我们概率方法的价值。
引用
@article{arxiv.0712.3900,
title = {Integrating heterogeneous knowledges for understanding biological behaviors: a probabilistic approach},
author = {Jérémie Bourdon and Damien Eveillard and Samuel Gabillard and Theo Merle},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.3900},
year = {2009}
}
备注
10 pages