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一类生化反应网络的路径互信息

分子网络 2019-04-04 v1 定量方法

摘要

活细胞在生化组分的时间动力学中编码并传递信息。因此,细致理解生物系统中的输入输出关系需要能够刻画生化组分完整时间轨迹间相互依赖性的定量测度。互信息提供了这样一种测度,但其在随机反应网络背景下的计算面临数学挑战。本文展示如何估计通过生化反应相互作用的两种分子物种完整路径间的互信息。我们利用三个简单案例研究演示了该方法。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.01988,
  title  = {Path mutual information for a class of biochemical reaction networks},
  author = {Lorenzo Duso and Christoph Zechner},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.01988},
  year   = {2019}
}

备注

6 pages, 2 figures