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MAPK通路中串扰介导信号转导的信息论研究

分子网络 2017-01-02 v2 统计力学 生物物理

摘要

与相似功能通路相关的生化网络常因不同网络中同源蛋白间的串扰而相关。使用随机框架,我们探讨了两条通路间串扰的功能意义。我们对通用MAPK通路的理论分析揭示串扰负责产生通路间协调波动。以信息论度量评估的相关程度为净信息传播提供了方向性。随机时间序列和散点图表明串扰在细胞内及细胞群体中生成同步。根据输入输出数量,我们识别出因复合网络中通路间连接产生的信号整合和信号分叉模体。使用部分信息分解的分析量化了通过这些分支通路信息传播的净协同。

关键词

引用

@article{arxiv.1510.04799,
  title  = {Information theoretical study of cross-talk mediated signal transduction in MAPK pathways},
  author = {Alok Kumar Maity and Pinaki Chaudhury and Suman K. Banik},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1510.04799},
  year   = {2017}
}

备注

Revised version, 17 pages, 5 figures