种群增长如何影响连锁不平衡
种群与进化
2014-06-10 v2
摘要
连锁不平衡（LD）通常使用“LD曲线”来总结，该曲线将位点对之间的LD与它们在染色体上分开的距离联系起来。本文展示了LD曲线如何响应种群规模的变化。种群规模的扩张会产生一条急剧下降的LD曲线，特别是如果这种扩张发生在瓶颈之后。种群规模的减少会产生一条高但相对平坦的LD曲线。在欧洲数据中，曲线陡峭，表明有种群扩张的历史。这些结论来自于对σ_d^2的研究，这是一种从未发挥核心作用的LD度量。它仅被视为另一种度量r^2的近似。然而，σ_d^2具有不同的动力学行为，并提供更深的时间深度。此外，它很容易从数据中估计，并且可以使用快速确定性算法从种群历史中预测。
引用
@article{arxiv.1308.1984,
title = {How Population Growth Affects Linkage Disequilibrium},
author = {Alan R. Rogers},
journal= {arXiv preprint arXiv:1308.1984},
year = {2014}
}