米氏曲线齐性检验及其在荧光共振能量转移数据中的应用

共振能量转移方法被广泛用于评估活细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质构象变化。荧光共振能量转移（FRET）测量能量转移作为受体：供体比率的函数，生成FRET饱和曲线。通过米氏动力学对这些曲线建模，可以用两个参数进行表征，这两个参数用于评估两种蛋白质之间的表观亲和力，并在不同实验条件下比较这种亲和力。为减少采样变异性的影响，在相同生物学条件下生成饱和曲线的多个统计样本。本文研究了三种程序，以确定一个集合中的统计样本是否齐性，即它们是否从同一回归模型中提取。从假设检验的角度，我们考虑了F检验和基于自助重抽样的程序。第三种方法从模型选择的角度分析问题，并使用赤池信息准则（AIC）。虽然我们只考虑了米氏模型，但所有统计程序都适用于任何其他非线性回归模型。我们通过蒙特卡罗研究以及在活细胞中分析CXCR4（G蛋白偶联受体家族中的一种七次跨膜受体）二聚体复合物的FRET饱和曲线，比较了这些齐性检验方法的性能。我们表明，F检验、自助法和模型选择方法通常得出相似的结论，尽管AIC在样本量较小时给出最佳结果，而F检验和自助法更适用于大样本。在实践中，这三种方法易于同时使用并显示出一致性，有助于得出关于样本齐性的结论。