沉积物纳米孔道中高通量过渡态搜索
材料科学
2025-04-15 v1 介观与纳米尺度物理
摘要
沉积物是涉及有机分子的工业催化过程中的重要材料。理解在受限纳米孔道环境中分子反应机理,可指导选取孔道拓扑结构、材料成分和工艺条件,以最大化活性和选择性。然而,实验机理研究耗时耗力,传统的分子模拟高度依赖专家直觉和手工操作化学结构,导致可扩展性差。本文提出了一种用于在纳米孔道中寻找过渡态的自动化计算管道。该方法通过DFT方法在气相中寻找过渡态,将其对准纳米孔道活性位点附近的有利取向进行 docking,然后利用气相反应模式作为 condensed-phase DFT 计算的种子,采用二面体方法。该方法绕过了繁琐的操作步骤,提高了过渡态搜索的成功率,无需进行漫长的路径跟随计算。本工作报告了迄今为止计算的沉积物约束过渡态的最大集合,使我们能够在框架、反应和反应物类型之间进行严格的机理趋势分析。我们以BOG、IWV、UTL和FAU沉积物中的二乙苯的脱烷化反应,以及BEA、FER、FAU、MFI和MOR沉积物中162个反应步骤的骨架异构化反应,演示了PoTS的适用性,两者均与实验结果良好一致。最后,我们提出了一套解决我们观察到的过渡态搜索不成功以及其他反应(如烯烃裂解)理论不足的途径。
引用
@article{arxiv.2504.08986,
title = {High-Throughput Transition-State Searches in Zeolite Nanopores},
author = {Pau Ferri-Vicedo and Alexander J. Hoffman and Avni Singhal and Rafael Gómez-Bombarelli},
journal= {arXiv preprint arXiv:2504.08986},
year = {2025}
}
备注
Main Paper; 12 Pages, 7 Figures. Method; 4 Pages, 1 Figure. Supplementary Information; 123 Pages, 59 Figures