HelixDesign-Antibody：基于 HelixFold3 的大规模抗体设计生产级平台
生物大分子
2025-07-04 v1 人工智能
摘要
抗体工程是发展治疗性制剂和推进生物医学研究的关键环节。传统的发现方法常依赖耗时且资源密集的实验筛选。为提升和优化该流程，本文引入基于 HelixFold3 的高精度结构预测模型，构建的生产级、高通量抗体设计平台——HelixDesign-Antibody。该平台支持大规模生成抗体候选序列并评估其与抗原的相互作用。集成的高性能计算（HPC）支持实现了高通量筛选，解决了工具链碎片化和计算需求高的问题。在多个抗原上的验证表明，平台能够生成多样且高质量的抗体，确认了探索更大序列空间可提高识别最优结合蛋白的概率。这一平台提供了大规模抗体设计的无缝、可访问解决方案，已可通过 PaddleHelix 平台的抗体设计页面获取。
关键词
引用
@article{arxiv.2507.02345,
title = {HelixDesign-Antibody: A Scalable Production-Grade Platform for Antibody Design Built on HelixFold3},
author = {Jie Gao and Jing Hu and Shanzhuo Zhang and Kunrui Zhu and Sheng Qian and Yueyang Huang and Xiaonan Zhang and Xiaomin Fang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2507.02345},
year = {2025}
}