核酸复合物中的卤素键合
化学物理
2017-09-08 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
卤素键合(X-bonding)在非共价相互作用中引起了显著关注。这种卤素原子与电子供体之间高度方向性的吸引力已在基于知识的药物设计中得到利用。关于蛋白质-配体复合物中 X-键的信息已大量积累,而核酸复合物则相反。本文对含有卤代结构单元或卤代配体的核酸复合物进行了透彻分析。我们分析了卤素与富电子部分之间的紧密接触。磷酸骨架氧显然是最常见的卤素受体。我们在已知的核酸复合物结构中鉴定出 21 个 X-键。绝大多数 X-键由卤代核苷酸碱基(如溴尿苷)形成,并具有优异的几何构型。非共价配体仅被发现形成具有次优相互作用几何构型的相互作用。因此,首个 X-键合的核酸结合剂仍有待发现。
引用
@article{arxiv.1709.02231,
title = {Halogen Bonding in Nucleic Acid Complexes},
author = {Michal H. Kolář and Oriana Tabarrini},
journal= {arXiv preprint arXiv:1709.02231},
year = {2017}
}
备注
19 pages, 12, figures, published