往返法：从单分子时间序列有效估计蛋白质的隐藏运动
化学物理
2015-05-20 v2 生物物理
摘要
我们提出了一种有效的方法，用于从单分子实验中附着探针粒子的运动来估计蛋白质的运动。该框架自然地结合了朗之万动力学来计算蛋白质最可能的轨迹。通过使用微扰展开技术，我们实现了比传统梯度下降法小四个数量级以上的计算成本，且计算算法没有丧失简单性。我们使用单分子实验的简单模型展示了该方法的说明性应用，并确认所提出的方法以高效的方式产生合理且稳定的隐藏运动估计。
引用
@article{arxiv.1011.4222,
title = {Go-and-Back method: Effective estimation of the hidden motion of proteins from single-molecule time series},
author = {Makito Miyazaki and Takahiro Harada},
journal= {arXiv preprint arXiv:1011.4222},
year = {2015}
}
备注
10 pages, 7 figures