用于蛋白质折叠模拟的广义系综算法

正则系综中复杂系统的传统模拟受限于准各态历经性问题。广义系综模拟通过在势能空间和其他参数空间执行随机行走来克服这一困难。仅通过一次模拟运行，利用单直方图和/或多直方图重加权技术，即可获得物理量作为温度函数的正则系综平均值。本文综述了广义系综算法。首先描述了三种著名方法，即多正则算法、模拟退火和副本交换方法。给出了这些算法的蒙特卡洛和分子动力学版本。随后，我们提出了对上述三种方法的进一步扩展。