多输入多输出回路破缺系统下多稳态等价基因调控网络构造方法的推广
动力系统
2014-01-03 v2 分子网络
定量方法
摘要
Schittler 等人 (2013) 近期探讨了不同维度的基因调控网络模型在多稳态性质方面的等价性问题。该工作的作者提出了当给定低维动力学系统和高维网络结构时，构造高维动力学系统的规则。然而，其中的证明仅限于所有内部反馈回路均可通过回路破缺方法打破从而产生单输入单输出 (SISO) 系统的系统类。在本报告中，我们将证明推广至具有任意数量内部反馈回路的系统，这些回路将通过广义回路破缺方法被打破，从而产生多输入多输出 (MIMO) 系统。该方法的推广使得构造方法适用于更广泛的基因调控网络模型类，从而促进了从核心模体模型到更 realistic、高维基因调控模型的结果转移。我们通过将其应用于间充质干细胞分化中的基因调控网络示例，展示了该方法的潜力和价值。
引用
@article{arxiv.1312.7250,
title = {Generalization of the construction method for multistability-equivalent gene regulatory networks to systems with multi-input multi-output loopbreaking},
author = {Daniella Schittler and Taouba Jouini and Frank Allgöwer and Steffen Waldherr},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.7250},
year = {2014}
}
备注
19 pages, 5 figures; Parts of the results here have been presented in a preliminary version, Multistability equivalence between gene regulatory networks of different dimensionality, which appeared in the Proceedings of the 12th European Control Conference (ECC)