配子体对蚊子的传染性：使用随机森林的变量选择与零膨胀模型
统计理论
2011-02-24 v3 种群与进化
定量方法
统计理论
摘要
旨在降低疾病传播强度的疟疾控制策略可能会影响蚊媒中的卵囊强度和感染流行率。迄今为止，数学模型未能确定恶性疟原虫配子体与其对蚊子传染性之间的明确关系。天然分离的配子体具有遗传多样性和生物学复杂性。对蚊子的传染性依赖于多个参数，如密度、性别比例、成熟度、寄生虫基因型和宿主免疫因子。在本文中，我们研究了配子体的密度和遗传多样性如何影响蚊媒中的传播成功。我们分析的数据中，协变量及其伴随交互作用的数量至少与样本量相当，这排除了使用经典模型（如广义线性模型）的可能性。因此，我们考虑了随机森林的变量重要性，以解决选择最具影响变量的问题。选定的协变量在零膨胀负二项模型中进行了评估，该模型同时处理了过度离散和非感染蚊子的来源。我们发现，与感染流行率和寄生虫强度相关的最重要协变量是配子体密度和感染复数。
引用
@article{arxiv.1101.0344,
title = {Gametocytes infectiousness to mosquitoes: variable selection using random forests, and zero inflated models},
author = {Robin Genuer and Isabelle Morlais and Wilson Toussile},
journal= {arXiv preprint arXiv:1101.0344},
year = {2011}
}