通过振荡纳米孔的频控实现蛋白质转运
软凝聚态物质
2018-04-18 v1
摘要
我们使用一种简化链与孔几何结构的唯象粗粒化计算模型研究了脂质结合蛋白（LBP）的转运。我们通过分子动力学考察了在截面以频率 omega 周期性随时间振荡（常被称为径向呼吸模式（RBM））的纳米孔存在下，输运与去折叠之间的相互作用。我们发现，当 LBP 被机械拉动进入振动纳米孔时，其转运动力学在某些频率范围内被加速，并显示出与孔动力学的频率锁定。孔振动的主要效应是抑制转运动力学的停滞事件，因此，适当的频率调谐可实现对整体输运过程的规整与控制。最后，借助基本驱动扩散过程的首通理论，可轻易解释模拟结果。
引用
@article{arxiv.1804.06393,
title = {Frequency-control of protein translocation across an oscillating nanopore},
author = {Fabio Cecconi and Muhammad Adnan Shahzad and Umberto Marini Bettolo Marconi and Angelo Vulpiani},
journal= {arXiv preprint arXiv:1804.06393},
year = {2018}
}
备注
14 pages, 11 figures, revtex4-1