高通量生物与临床数据中基于有理数的分形分布
定量方法
2010-10-22 v1 概率论
应用统计
摘要
提取和处理生物与临床数据的最新进展使得定量研究生命系统成为可能。高通量测序、表达谱、蛋白质组学和电子健康记录是此类技术的一些例子。从这些技术中提取有意义的信息需要仔细分析它们产生的大量数据。在这篇笔记中，我们提出了一组在分析此类数据时常见的分布。这些分布呈现一些有趣的特征：它们在有理数上不连续，但在无理数上连续，并具有某种自相似（分形）结构。我们在此呈现的第一组例子来自高通量测序实验。在这里，自相似分布作为评估测序技术错误率和识别致瘤基因组改变的一部分出现。其他例子来自风险因素评估以及相对疾病患病率和共病性的分析，这些出现在电子临床数据中。这些分布也与肿瘤中亚克隆群体的识别以及传染病进化的研究相关，更确切地说，与病毒群体的准种和宿主内多样性的研究相关。
引用
@article{arxiv.1010.4328,
title = {Fractal-like Distributions over the Rational Numbers in High-throughput Biological and Clinical Data},
author = {Vladimir Trifonov and Laura Pasqualucci and Riccardo Dalla-Favera and Raul Rabadan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1010.4328},
year = {2010}
}
备注
16 pages, 4 figures