ATP依赖的染色质重塑马达的足迹遍历
生物物理
2015-03-19 v3 亚细胞过程
摘要
ATP依赖的染色质重塑酶（CRE）是真核细胞中的生物分子马达。它们由化学燃料——三磷酸腺苷（ATP）驱动。CRE 积极参与许多需要特定 DNA 片段可及性的细胞过程，这些 DNA 被包装成染色质。染色质的基本单位是核小体，其中 146 bp（约 50 nm）的双链 DNA（dsDNA）缠绕在由组蛋白形成的线轴上。核小体上组蛋白-DNA 接触的螺旋路径也称为“足迹”。我们研究了沿 dsDNA 易位的 CRE 遍历足迹的机制。我们的 CRE 两态模型有效地捕捉了每个 ATP 依赖的 CRE 在机械化学循环中的两个不同化学（或构象）状态。我们计算了平均遍历时间。我们对平均遍历时间 ATP 依赖性的预测可以通过对单核小体进行体外实验来检验。
引用
@article{arxiv.1107.1442,
title = {Footprint traversal by ATP-dependent chromatin remodeler motor},
author = {Ashok Garai and Jesrael Mani and Debashish Chowdhury},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.1442},
year = {2015}
}
备注
11 pages, 12 figures; minor revision of text