DNA轨道上的RNA聚合酶马达：相互作用、外力与扭矩的影响
生物物理
2009-06-04 v4 统计力学
亚细胞过程
摘要
RNA聚合酶（RNAP）是一个移动的分子车间，它通过逐个添加单体亚基来聚合RNA分子，同时在DNA模板上逐步移动。在此，我们通过引入RNAP的空间相互作用及其 mechanochemical 循环建立了一个理论模型，该模型显式地捕捉了每个马达的周期性形状变化。利用该模型，我们不仅解释了RNAP平均速度对外加负载力的依赖性，还预测了平均速度对外部扭矩的非单调变化。我们还展示了马达空间相互作用对RNA合成总速率的影响。原则上，我们的预测可以通过我们在此建议的体外实验进行验证。
引用
@article{arxiv.0812.4692,
title = {RNA polymerase motor on DNA track: effects of interactions, external force and torque},
author = {Tripti Tripathi and Prasanjit Prakash and Debashish Chowdhury},
journal= {arXiv preprint arXiv:0812.4692},
year = {2009}
}