RNA聚合酶马达：驻留时间分布、速度与动力学相
统计力学
2015-05-13 v1 生物物理
亚细胞过程
摘要
RNA从模板DNA上的聚合由一种称为RNA聚合酶（RNAP）的分子机器完成。它还利用模板作为轨道，作为马达在其上移动，并消耗化学能输入。它在DNA每个连续单体上停留的时间是随机的；我们在模型中推导了这些“驻留时间”的精确分布。平均驻留时间的倒数满足类似米氏方程的形式，并且也与Fisher和Kolomeisky先前针对具有无分支机械化学循环的分子马达推导的一般公式一致。通常，多个RNAP马达在同一轨道上同时移动。将RNAP之间的空间相互作用纳入我们的模型，我们还利用极值电流假设绘制了RNAP交通模型的三维相图。
引用
@article{arxiv.0904.2625,
title = {RNA polymerase motors: dwell time distribution, velocity and dynamical phases},
author = {Tripti Tripathi and Gunter M. Schütz and Debashish Chowdhury},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.2625},
year = {2015}
}
备注
6 pages, 7 figures