关于生命之树的五个统计学问题
种群与进化
2013-02-07 v1
摘要
对系统发育树的随机建模提出了五个问题，这些问题受到了定量生物学家的不同程度的关注。1) 根据模型，我们预期最大历史多样性与当前多样性的比率有多大？2) 从一个分支群现存物种的正确系统发育树中，我们可以推断出过去的物种形成率和灭绝率是多少？3) 现存物种中有多少比例实际上是仍存活的祖先物种的后代，这与模型预测相比如何？4) 当从物种树转向物种集合的树（无论是传统的高级分类单元还是来自 PhyloCode 的分支群）时，人们是否预期树会变得更加无偏，而这仅仅是树结构的逻辑结果，并不表示任何真实的生物现象？5) 我们预期高级分类单元计数的波动率与物种数量的波动率相比如何？我们基于一个过度简化的建模框架提出了数学家的观点，在该框架中可以连贯地研究所有这些问题。
引用
@article{arxiv.1302.1440,
title = {Five Statistical Questions about the Tree of Life},
author = {Lea Popovic and Maxim Krikun and David Aldous},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.1440},
year = {2013}
}
备注
11 pages, 3 figures