氨基-based硒硫硫醛与谷胱甘肽还蛋白酶相互作用:分子动力学视角
化学物理
2025-12-05 v1
摘要
在寻找小分子有机硒类谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)模拟剂的过程中,发现基于氨基的硒硫硫醛(RSeSG)可在谷胱甘肽还蛋白酶(GR)的催化位点上被还原,从而增强这些模拟剂在生物系统中的催化效率。然而,由于缺乏硒硫构象的力场参数,目前对这些相互作用的分子认识仍不足。本研究开发了基于通用Amber力场(GAFF)的硒硫硫醛力场参数,所采用硒硫骨架为苯硫醚。利用这些参数,进行了为期200纳秒的RSeSG分子动力学(MD)模拟。结果表明,氨基氮及其取代基均显著影响RSeSG在GR催化位点上的相互作用。
引用
@article{arxiv.2512.04664,
title = {Fate of amine-based selenenyl sulfides during interaction with glutathione reductase: a molecular dynamics perspective},
author = {Vishnu Rama Chari and Raghu Nath Behera},
journal= {arXiv preprint arXiv:2512.04664},
year = {2025}
}