纳米受限DNA的伸展：实验与理论的定量比较
生物物理
2015-12-22 v2 软凝聚态物质
摘要
限制在纳米通道中的DNA的伸展已被深入详细研究。然而实验与模型计算之间的定量比较是困难的，因为大多数理论预测涉及未确定的前因子，并且模型参数（轮廓长度、Kuhn长度、有效宽度）难以可靠计算，导致显著不确定性。这里我们使用最近的用于“扩展de Gennes区”中DNA伸展的渐近精确理论，使我们能比较实验结果与理论。为此我们进行新实验，测量平均DNA伸展及其标准偏差，同时改变通道几何、染料嵌入比和离子缓冲强度。实验结果在高离子强度下与理论非常一致，表明模型参数可靠。低离子强度下一致性较差。我们讨论可能原因。我们的方法原则上允许测量单条DNA分子以及更一般地溶液中半柔性聚合物的Kuhn长度和有效宽度。
引用
@article{arxiv.1506.02241,
title = {Extension of nano-confined DNA: quantitative comparison between experiment and theory},
author = {V. Iarko and E. Werner and L. K. Nyberg and V. Müller and J. Fritzsche and T. Ambjörnsson and J. P. Beech and J. O. Tegenfeldt and K. Mehlig and F. Westerlund and B. Mehlig},
journal= {arXiv preprint arXiv:1506.02241},
year = {2015}
}
备注
Revised version, 6 pages, 2 figures, 1 table, supplementary material