用于理解蛋白质侧链动力学的显式运动模型
化学物理
2022-11-23 v2
摘要
核磁共振弛豫被广泛用于探测蛋白质动力学。数十年来，蛋白质弛豫的大多数分析都成功依赖于无模型方法，放弃了运动的机制性描述。无模型类型的关联函数无法描述蛋白质侧链中一个大型碳-13弛豫数据集。在此，我们利用分子动力学模拟设计显式运动模型并求解Fokker-Planck扩散方程。这些运动模型与弛豫数据具有更好的一致性，提供了机制性见解，并与构型熵建立直接联系。
引用
@article{arxiv.2204.05813,
title = {Explicit models of motions to understand protein side-chain dynamics},
author = {Nicolas Bolik-Coulon and Olivier Languin-Cattoën and Diego Carnevale and Milan Zachrdla and Damien Laage and Fabio Sterpone and Guillaume Stirnemann and Fabien Ferrage},
journal= {arXiv preprint arXiv:2204.05813},
year = {2022}
}