基于广义尖峰总体模型的尖峰个数估计及其在RNA-seq数据中的应用
统计方法学
2018-05-01 v1
摘要
尽管广义尖峰总体模型在随机矩阵理论中已被积极研究，其在真实数据上的应用却鲜有探索。我们发现，大多数基于Johnstone尖峰总体模型确定尖峰个数的方法在RNA-seq基因表达数据中会选出过多尖峰，或常因指示所有分量均为尖峰而无法确定尖峰个数。本文中，我们提出一种基于广义尖峰总体模型的尖峰个数估计新算法。同时，基于总体谱分布思想为RNA-seq数据提出一种新的噪声模型，其利用所提算法给出生物学上合理的尖峰个数。此外，我们提出一种图形工具以评估底层噪声模型的性能。
引用
@article{arxiv.1804.10675,
title = {Estimation of the number of spikes using a generalized spike population model and application to RNA-seq data},
author = {Hyo Young Choi and J. S. Marron},
journal= {arXiv preprint arXiv:1804.10675},
year = {2018}
}