长链非编码RNA在从头染色质修饰中的关键作用:基因组地址码假说
基因组学
2017-04-07 v1
摘要
表观基因组,即染色质修饰的整体,在细胞分化过程中从母细胞传递给子细胞。然而,当子细胞发生从头染色质修饰(分别建立或擦除新的或预先存在的DNA甲基化和/或组蛋白修饰)时,其表观基因组与母细胞不同。尽管从头染色质修饰是包含细胞分化基本过程的重要事件,其分子机制仍知之甚少。我们在本通讯中认为,解决此问题的关键在于理解长链非编码RNA(lncRNAs)的作用——这类RNA在表观遗传研究中日益突出。许多研究表明,lncRNAs在细胞核中形成核糖核蛋白复合物并参与染色质修饰。然而,染色质修饰酶缺乏关于其作用基因组位置的信息。另一方面,已知单链RNA通常可与双链DNA结合形成三螺旋。如果每种lncRNA一方面与染色质修饰酶形成核糖核蛋白复合物,同时另一方面基于其特定核苷酸序列与基因组区域形成三螺旋,则它能在特定位点诱导从头染色质修饰。因此,lncRNAs的巨大多样性可由对其同源基因组区域(发生从头染色质修饰处)特异的“基因组地址码”的多样性需求来解释。
引用
@article{arxiv.1703.02667,
title = {Essential role of long non-coding RNAs in de novo chromatin modifications: The genomic address code hypothesis},
author = {Ken Nishikawa and Akira R. Kinjo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.02667},
year = {2017}
}
备注
12 pages, 1 figure