遗传电路中资源竞争下涌现的调控响应与半诱导点的偏移
分子网络
2021-12-10 v1 定量方法
摘要
合成遗传电路在活细胞中实现其运作。在基因表达过程中,蛋白质由各自基因通过转录和翻译过程形成复合物而产生。在转录中,电路使用RNAP等作为来自宿主细胞的资源;在翻译中,核糖体、tRNA和其他细胞资源被提供给运作中的电路。由于细胞中这些资源数量有限,电路可能遭受前所未有的资源竞争,这可能破坏电路功能,或引入一些涌现响应。在本文中,我们研究了一个处于资源竞争下的三基因基序,其中由于必要资源的有限供应,出现了类似于调控响应的有趣行为。所关注的系统表现出显著的行为变化,可在实验中观察到。我们关注两个具体方面,即动态范围和半诱导点,它们固有地描述了电路功能,并可能受相应资源亲和力和可用性的影响。
引用
@article{arxiv.2112.04985,
title = {Emergent Regulatory Response and Shift of Half induction point under Resource Competition in Genetic circuits},
author = {Priya Chakraborty and Sayantari Ghosh},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.04985},
year = {2021}
}
备注
10 pages, 6 figures