合成基因网络的电子电路模拟：再探
生物物理
2017-07-07 v1
摘要
电子电路是研究合成基因网络潜在动力学行为的实用工具。电路模型是对网络数值模拟的补充，尤其为在电气系统固有和外在噪声存在下验证动力学行为提供了框架。这里我们呈现了先前设计的基因网络电子模拟的改进版本，该版本包含 3 基因 Repressilator，并展示了模型参数与真实电路元件值之间的转换，以在实验中模拟数值结果。电路设计的重要特征包括引入代表 Hill 函数抑制的化学校应动力学、群体感应耦合和加性噪声。特别地，我们设计了可在实验中系统改变初始条件的电路，这对于研究动力学系统行为至关重要，尤其当其展现多稳态时。这种改进的合成基因网络电子模拟使我们能将研究从孤立的 Repressilator 扩展到耦合的 Repressilator，并揭示动力学行为的复杂性。
引用
@article{arxiv.1607.06510,
title = {Electronic Circuit Analog of Synthetic Genetic Networks: Revisited},
author = {Edward H. Hellen and Syamal K. Dana},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.06510},
year = {2017}
}
备注
21 pages, 13 figures