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DNA呼吸动力学:弱噪声分析、有限时间奇异性及其映射到量子库仑问题

统计力学 2008-06-02 v1 软凝聚态物质

摘要

基于波兰-Scheraga模型,我们研究了双链DNA中变性泡的动力学。我们表明,DNA泡的长期存活分布和尺寸自相关函数可以从渐近弱噪声方法中推导得出。特别地,在熔点温度以下,气泡闭合对应于一个含噪声的有限时间奇异性。我们证明相关的福克-普朗克方程等价于一个量子库仑问题。在熔点温度以下,气泡寿命与排斥性库仑势的散射态连续谱相关联;在熔点温度处,库仑势消失,基础的首出动力学表现出长时间幂律尾部;在熔点温度以上,对应于吸引性库仑势,长期动力学由最低束缚态控制。还讨论了关联效应和有限尺寸效应。

关键词

引用

@article{arxiv.0706.4401,
  title  = {Dynamics of DNA-breathing: Weak noise analysis, finite time singularity, and mapping onto the quantum Coulomb problem},
  author = {Hans C. Fogedby and Ralf Metzler},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0706.4401},
  year   = {2008}
}

备注

12 pages, 10 figures, revtex