水中尿素与甘氨酸多晶型的成核驱动与表征
软凝聚态物质
2024-04-05 v2 统计力学
摘要
晶体成核在基础与应用科学领域均具重要意义。然而,许多情况下因其时间或空间分辨率不足,其机制仍不清楚。为深入认识成核的分子细节,通常进行某种分子动力学模拟;这些模拟又受限于能否运行足够长时间以充分采样成核事件。为以无先验人为偏置的方式克服典型分子动力学模拟的时标限制,本文采用机器学习增强的分子动力学框架“用于增强采样的重加权自编码变分贝叶斯(RAVE)”。我们研究两个分子体系——显式全原子水中的尿素和甘氨酸,因其多晶型结构丰富且常用于商业应用。模拟中,我们观察到不同多晶型的多次液-固来回转变,并据此轨迹计算出相对于溶解液态的多晶型稳定性。我们进一步观察到所获得的反应坐标与转变高度非经典。
引用
@article{arxiv.2210.04822,
title = {Driving and characterizing nucleation of urea and glycine polymorphs in water},
author = {Ziyue Zou and Eric Beyerle and Sun-Ting Tsai and Pratyush Tiwary},
journal= {arXiv preprint arXiv:2210.04822},
year = {2024}
}
备注
12 pages, 7 figures