基因组中的散度与香农信息
基因组学
2009-11-10 v1
摘要
香农信息（SI）及其特例散度，是针对DNA序列根据序列中化学字的概率定义的，并对一组在长度和组成上高度多样化的完整基因组进行了计算。我们发现如下：对于随机序列，SI（而非散度）与序列长度成反比，但对于基因组则与长度无关；基因组SI总是更大，且对于较短字和较长序列，比长度和组成与基因组匹配的随机序列中的SI大数百到数千倍；基因组SI似乎具有依赖于字长的普适值。推断这种普适性是基因组增长的普适模式的进化足迹。
引用
@article{arxiv.q-bio/0412037,
title = {Divergence and Shannon information in genomes},
author = {Hong-Da Chen and Chang-Heng Chang and Li-Ching Hsieh and Hoong-Chien Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0412037},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 3 tables, 2 figures