长程相关序列的信息度量：24 条人类染色体序列的案例
基因组学
2013-10-30 v2 数据分析、统计与概率
定量方法
摘要
提出了一种估算长程相关序列 Shannon 熵的新方法。该熵被写为两项之和，分别对应于幂律分布（有序）和指数分布（无序）的块（簇）。该方法以核苷酸组合作为待编码/解码的相关信息，在 24 条人类染色体序列上进行了演示。有趣的是，研究发现有序簇的核苷酸组成平均而言与整个分析序列的组成相当，而无序簇的组成则存在波动。从信息论的角度来看，这意味着幂律相关簇携带的信息与整个分析序列相同。此外，无序簇核苷酸组成的波动与相关的生物学特性（如节段重复和基因密度）相关联。
引用
@article{arxiv.1302.0784,
title = {Information Measures for Long-Range Correlated Sequences: the Case of the 24 Human Chromosome Sequences},
author = {Anna Carbone},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.0784},
year = {2013}
}
备注
Scientific Reports (2013)